Este taller tiene por objetivo conocer el software Zotero para facilitar la incorporación de citas y referencias en archivos RMarkdown.
Para este práctico utilizaremos una librería pública en Zotero, que nos facilitará la realización de los ejercicios.
Como se vio en el tutorial de instalación, una vez teniendo instalado el software y sus complementos, es necesario tener en cuenta el flujo de trabajo.
Es importante entender el flujo de trabajo de Zotero + RMarkdown, ya que resume todo lo visto, mientras más nos acostumbremos a este flujo de trabajo más simple se hará el proceso de referenciar a través de Zotero.
El primer paso es almacenar los datos que se han leído y recopilado. El almacenamiento inmediato de estos datos será de utilidad para el reporte.
Para esto Zotero, no sólo tiene la solución, sino que también existen diversas formas de hacerlo. Las cuales veremos a continuación
Una de las formas más comunes (aunque no más fácil) es almacenar las referencias de forma manual.
Se debe considerar que si bien esto facilita el proceso, hay formas más expeditas de almacenamiento.
Para esto debemos seguir los siguientes pasos:
Paso 1: Abrir Zotero
Paso 2: Dirigirse al botón verde con un signo “+” y seleccionar el tipo de archivo a almacenar (artículo, libro, vídeo, etc.)
Otra de las opciones que ofrece Zotero es el almacenamiento a través del identificador (DOI, ISBN, PMID o arXiv ID), los pasos a seguir son los siguientes:
Paso 1: Tener el identificador copiado (para este ejemplo utilizaremos este 978-84-459-0745-0, ustedes también pueden probar con ese ISBN)
Paso 2: Abrir Zotero Paso 3: Ir a al dibujo de una “varita”
Paso 3: Ingresar el identificador
¡Listo!
Una última forma de almacenar referencias es a través de archivos.
Paso 1: Tener un archivo para almacenar
Paso 2: Moverlo a Zotero
¡Listo!
Una vez almacenados, se viene la siguiente etapa de nuestro flujo: la de exportación y hay dos opciones para exportar los archivos
Opción 1: Exportar archivos con formato .bib
Paso 1: Botón derecho a la carpeta a exportar
Paso 2: Apretar en “Exportar colección”
Paso 3: Seleccionar formato BibTeX
Paso 4: Seleccionar carpeta donde alojaremos el archivo (input) y guardar
Opción 2: Exportar archivos con BetterBibTeX
Con esta opción Rstudio automáticamente reconoce la biblioteca, los pasos son los siguientes:
Paso 1: Botón derecho a la carpeta a exportar
Paso 2: Apretar en “Exportar colección”
Paso 3: Seleccionar formato BibTeX y opción keep updates
Paso 4: Seleccionar carpeta donde alojaremos el archivo (input) y guardar
Para incluir las citas en un documento RMarkdown se debe tener en consideración dos aspectos, el archivo que almacena las citas y el formato en el que queremos referenciar. Por eso en el YAML se deben especificar estos dos aspectos
Para este aspecto en el encabezado (YAML) debe especificarse con bibliography la ruta hacia el archivo, el nombre del archivo y su extensión
Nuestro YAML quedaría así
---
title: "taller zotero"
author: "Dafne Jaime Vargas"
date: "30-09-2021"
output: html_document
bibliography: input/taller.bib
link-citations: yes
---
Tan relevante como el reverenciar, lo es el formato en el que se referencia, para ello debemos ir al siguiente link y descargar el formato con el que se quiere citar
¿Cómo se descarga?, para este proceso hay varias opciones:
Opción 1: Descargar el archivo
Paso 2: Una vez les salga el mensaje de “Zotero Connector”, apretar en cancel
Les descargará un archivo con extensión .csl
Finalmente, en su archivo RMarkdown, en la sección del YAML deben dejar la ruta hacia el archivo, el nombre del archivo y su formato
¡Listo!
Opción 2:
Paso 1: Poner en el buscador el estilo de citación y hacerle click
Paso 2: Una vez les salga el mensaje de “Zotero Connector”, apretar en OK
Luego ir a preferencias de Zotero
En la sección “Exportar” deben elegir formato predeterminado
En esta ocasión nuestro en nuestro YAML no habría que especificar un estilo de citación
Opción 3:
Paso 1: Poner en el buscador el estilo de citación y copiar el link
¡Listo!
Ahora ya podemos citar, y es muy simple sólo debemos abrir nuestro RMarkdown
Hacer click en Addins > insert citations o citr:::insert_citation()
Luego hacer knit
¡Listo!
{{< div “note” >}}
En Zotero no sólo se puede almacenar los datos de la referencia y sus archivos, sino que se pueden añadir notas, apuntes, etiquetas, entre otros
{{< /div >}}
Ya puedes volver a leer, Zotero hará todo lo demás por ti. Solo recuerda los pasos a seguir