0. Objetivo del taller

Este taller tiene por objetivo conocer el software Zotero para facilitar la incorporación de citas y referencias en archivos RMarkdown.

1. Recursos del práctico

Para este práctico utilizaremos una librería pública en Zotero, que nos facilitará la realización de los ejercicios.

2. Flujo de trabajo

Como se vio en el tutorial de instalación, una vez teniendo instalado el software y sus complementos, es necesario tener en cuenta el flujo de trabajo.

Es importante entender el flujo de trabajo de Zotero + RMarkdown, ya que resume todo lo visto, mientras más nos acostumbremos a este flujo de trabajo más simple se hará el proceso de referenciar a través de Zotero.

3.1 Almacenar

El primer paso es almacenar los datos que se han leído y recopilado. El almacenamiento inmediato de estos datos será de utilidad para el reporte.

  • Una de las ventajas de realizar el proceso de almacenar de esta forma es que se lleva un registro de lo leído, evitando la pérdida de información.

Para esto Zotero, no sólo tiene la solución, sino que también existen diversas formas de hacerlo. Las cuales veremos a continuación

3.2 Almacenar referencias de forma manual

Una de las formas más comunes (aunque no más fácil) es almacenar las referencias de forma manual.

Se debe considerar que si bien esto facilita el proceso, hay formas más expeditas de almacenamiento.

Para esto debemos seguir los siguientes pasos:

  • Paso 1: Abrir Zotero

  • Paso 2: Dirigirse al botón verde con un signo “+” y seleccionar el tipo de archivo a almacenar (artículo, libro, vídeo, etc.)

  • Paso 3: Finalmente, deben llenar las secciones que aparecen en el lado derecho.

3.3 Almacenar a través de la extensión de navegador

Almacenar a través de la extensión del navegador web, es una de las opciones más simples de almacenamiento, solo debes seguir los siguientes pasos:

  • Paso 1: Dirigirte al artículo, noticia, vídeo que quieras almacenar

  • Paso 2: Apretar el botón de la extensión

  • Paso 3: Seleccionar la carpeta donde se almacenará

¡Listo!

3.4 Almacenar a través del identificador

Otra de las opciones que ofrece Zotero es el almacenamiento a través del identificador (DOI, ISBN, PMID o arXiv ID), los pasos a seguir son los siguientes:

  • Paso 1: Tener el identificador copiado (para este ejemplo utilizaremos este 978-84-459-0745-0, ustedes también pueden probar con ese ISBN)

  • Paso 2: Abrir Zotero Paso 3: Ir a al dibujo de una “varita”

  • Paso 3: Ingresar el identificador

¡Listo!

3.5 Almacenar por archivo

Una última forma de almacenar referencias es a través de archivos.

  • Paso 1: Tener un archivo para almacenar

  • Paso 2: Moverlo a Zotero

¡Listo!

3.2 Exportar y formatos

Una vez almacenados, se viene la siguiente etapa de nuestro flujo: la de exportación y hay dos opciones para exportar los archivos

Opción 1: Exportar archivos con formato .bib

  • Paso 1: Botón derecho a la carpeta a exportar

  • Paso 2: Apretar en “Exportar colección”

  • Paso 3: Seleccionar formato BibTeX

  • Paso 4: Seleccionar carpeta donde alojaremos el archivo (input) y guardar

Opción 2: Exportar archivos con BetterBibTeX

Con esta opción Rstudio automáticamente reconoce la biblioteca, los pasos son los siguientes:

  • Paso 1: Botón derecho a la carpeta a exportar

  • Paso 2: Apretar en “Exportar colección”

  • Paso 3: Seleccionar formato BibTeX y opción keep updates

  • Paso 4: Seleccionar carpeta donde alojaremos el archivo (input) y guardar

3.3 Carpeta

3.4 YAML: bibliography y csl

Para incluir las citas en un documento RMarkdown se debe tener en consideración dos aspectos, el archivo que almacena las citas y el formato en el que queremos referenciar. Por eso en el YAML se deben especificar estos dos aspectos

3.4.1 Especificar carpeta de donde se extraen las referencias

Para este aspecto en el encabezado (YAML) debe especificarse con bibliography la ruta hacia el archivo, el nombre del archivo y su extensión

Nuestro YAML quedaría así

---
title: "taller zotero"
author: "Dafne Jaime Vargas"
date: "30-09-2021"
output: html_document
bibliography: input/taller.bib
link-citations: yes
---

3.4.2 formato de citación

Tan relevante como el reverenciar, lo es el formato en el que se referencia, para ello debemos ir al siguiente link y descargar el formato con el que se quiere citar

¿Cómo se descarga?, para este proceso hay varias opciones:

Opción 1: Descargar el archivo

  • Paso 1: Poner en el buscador el estilo de citación y hacerle click

  • Paso 2: Una vez les salga el mensaje de “Zotero Connector”, apretar en cancel

  • Les descargará un archivo con extensión .csl

  • Finalmente, en su archivo RMarkdown, en la sección del YAML deben dejar la ruta hacia el archivo, el nombre del archivo y su formato

¡Listo!

Opción 2:

  • Paso 1: Poner en el buscador el estilo de citación y hacerle click

  • Paso 2: Una vez les salga el mensaje de “Zotero Connector”, apretar en OK

  • Luego ir a preferencias de Zotero

  • En la sección “Exportar” deben elegir formato predeterminado

  • En esta ocasión nuestro en nuestro YAML no habría que especificar un estilo de citación

Opción 3:

Paso 1: Poner en el buscador el estilo de citación y copiar el link

  • Paso 2: ir al RMarkdown y poner el link dentro de csl:

¡Listo!

4. Citar en RMarkdown

¡Listo!

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BONUS

En Zotero no sólo se puede almacenar los datos de la referencia y sus archivos, sino que se pueden añadir notas, apuntes, etiquetas, entre otros

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Ya puedes volver a leer, Zotero hará todo lo demás por ti. Solo recuerda los pasos a seguir